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专利基本信息
专利名称 CRISPR-Cas9系统sgRNA作用靶点的筛选方法及装置
专利状态 - 专利号(申请号) CN106845151B
专利申请日期 2015-12-07 专利类型 发明专利
申请公布号 2015108887554 申请公布日 2015-12-07
授权公告号 - 授权公告日 -
发明人 赵毅强;高菲;王宇哲;许文杰;胥春龙;吴森;胡晓湘
专利权人 中国农业大学
专利摘要 本发明涉及CRISPR‑Cas9系统sgRNA作用靶点的筛选方法,包括:(1)利用已公布物种的全基因组序列及基因注释信息,获取基因组中具有5’‑Nx‑NGG‑3’序列的区段(x为19~22之间的整数,N代表A/T/C/G),作为CRISPR‑Cas9系统sgRNA的候选靶点;(2)将基因组打断成22~25bp的片段并筛选以NGG结尾的,且在基因组上无重复的序列;(3)将步骤(1)的候选靶点序列与步骤(2)中筛到的序列进行比对,根据错配信息及评选公式对相应的优选序列进行筛选及排序,获取最优的全基因组sgRNA作用靶点集合。本发明还提供用于实现上述筛选方法的装置。本方法适用于所有已知基因组及其基因注释信息的物种,快速高效获得其全基因组水平的sgRNA序列全集来构建基因敲除突变体文库或基因敲除动物模型。
专利价值评估分析
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