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专利基本信息
专利名称 一种蛋白质鉴定方法及系统
专利状态 - 专利号(申请号) CN107727727B
专利申请日期 2017-11-13 专利类型 发明专利
申请公布号 2017111136757 申请公布日 2017-11-13
授权公告号 - 授权公告日 -
发明人 尹文波;王伶俐;仇进;康萍
专利权人 复旦大学
专利摘要 本发明属于生物分析技术领域,具体为一种蛋白质鉴定方法及系统。本发明方法包括:根据蛋白酶对待测蛋白质进行酶切操作,利用蛋白质串联质谱技术获得待测蛋白质的二级质谱;对蛋白质数据库中的蛋白质序列进行虚拟酶切操作,提取符合要求的第一类肽段;利用FPGA加速算法根据第一类肽段生成理论谱;利用FPGA加速模块将待测蛋白质的二级质谱与理论谱对比,进行相似性打分;将得分结果最高的理论谱对应的肽段序列确定为蛋白质的肽段序列;依次确定蛋白质的所有肽段序列,得到蛋白质序列。采用本发明所提供的蛋白质鉴定方法及系统,实现了在FPGA上加速,整个打分过程加速约为25倍左右,加速效果良好,提高了系统的运行效率。
专利价值评估分析
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