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专利基本信息
专利名称 一种基于基因本体信息的蛋白质序列表示方法
专利状态 - 专利号(申请号) CN106845149B
专利申请日期 2017-02-09 专利类型 发明专利
申请公布号 2017100710926 申请公布日 2017-02-09
授权公告号 - 授权公告日 -
发明人 肖绚;程翔
专利权人 景德镇陶瓷大学
专利摘要 本发明涉及一种新的基于基因本体信息的蛋白质序列表示方法,首先使用BLAST程序搜索Swiss‑Prot数据库找到蛋白质序列P所有的相似蛋白质序列,将训练数据集中所有蛋白质输入到GO数据库中,搜寻每个蛋白质所具有的GO本体信息;然后在基因本体库中搜寻P蛋白质所具有的标注基因本体信息;根据预测问题具有的M个标签,将P蛋白质定义为M个元素的离散向量。本方法通过将序列集中的蛋白质GO信息,融合成新的蛋白质P的向量描述,使得采用GO方法维度**降低,用于蛋白质亚细胞多标签定位预测和抗菌肽功能多标签预测中,能明显提高相关预测器的预测成功率,具有广阔的运用前景。
专利价值评估分析
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