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专利基本信息
专利名称 一种基于计算机模拟获取可调控的TRPV5变异体的方法
专利状态 - 专利号(申请号) CN110634533A
专利申请日期 2019-08-27 专利类型 发明专利
申请公布号 201910793867X 申请公布日 2019-08-27
授权公告号 - 授权公告日 -
发明人 沈勇;谭俊杰
专利权人 中山大学
专利摘要 本发明公开了一种基于计算机模拟获取可调控的TRPV5变异体的方法。所述方法首先采用CHARMM‑GUI对通道蛋白质进行变异处理,随后使用Amber16中的分子动力学模拟模块pmemd.cuda对不同状态下的TRPV5通道蛋白变异体阳离子进行模拟,最后结合使用VMD和Amber16中的cpptraj模块分析阳离子的运动路径,来验证该TRPV5通道蛋白变异体的通道性能。本发明可对整个模拟体系的运动轨迹进行研究解析,克服了中间状态难以连续观测的难题,并且能够直观地观测到阳离子在极短的时间尺度内的运动变化。整个计算过程效率高,耗时短,操作简单,有助于在生物化学、蛋白质工程学等领域的广泛应用。
专利价值评估分析
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